武汉市疾病预防控制中心的前身为武汉市卫生防疫站。武汉市卫生防疫站于1952年10月6日经武汉市人民政府卫生局批准建立，属武汉市卫生局主管、有独立法人的卫生事业单位。中心于2005年3月正式通过中国实验室国家认可委的认可，这标志中心的检测能力在国内乃至国际检测市场上得到承认（认可证书 NO.L2002）。中心集疾病预防控制、公共卫生技术管理、监测检验与评价、健康教育与促进、应用研究与指导、技术管理与服务为一体，是武汉市卫生监测、检验出证、技术仲裁、预防医学研究的疾病预防控制机构。