从事慢性病预防与控制工作13年，先后主持承担研究项目：人群超额死亡与环境相关风险研究(武汉市科技局);社区糖尿病患者个体化健康管理干预效果及卫生经济学评价(湖北省卫健委);武汉市卫生健康大数据疾病负担平台构建及关键技术研究(湖北省卫健委);武汉地区老年人口健康老龄化现状及主动应对策略研究(湖北省卫健委);大气污染与居民心血管疾病死亡风险研究，提高恶性肿瘤患者生存质量的社区管理模式研究(武汉市卫生局);参与课题青少年新型毒品滥用预防的‘认知-技能-心理成长’干预模式研究(国家自然科学基金项目，与同济医科大学合作)。主要研究方向：为慢性病流行病学及干预策略研究。

入选武汉市人民政府博士津贴资助(2012-2014年)、武汉市中青年医学骨干人才培养对象(2014-2016年)。2014年12月，《社区高血压患者规律运动影响因素、理论模式及干预效果评估》通过武汉市科技局成果鉴定，达到国际先进水平，获武汉市科技进步三等奖，湖北省预防医学科学技术二等奖(排名第4)。《高血压患者运动指南》 ，获武汉市科技局优秀科普作品奖，武汉市科技局，2018.(副主编)。2020年，获全国死因登记报告(2004-2019年)工作突出贡献先进个人奖，湖北省肿瘤随访登记工作先进个人。

1. Yan Yaqiong, Chen Xi, Guo Yan, et al. Ambient air pollution and cerebrovascular disease mortality: an ecological time-series study based on 7-year death records in central China Environmental Science and Pollution Research. Environmental Science and Pollution Research. 2021.2,https://doi.org/10.1007/s11356-021-12474-z.
2. Yan Yaqiong, Lu She, Guo Yan et tl. Association Between Ambient Air Pollution and Mortality From Chronic Obstructive Pulmonary Disease in Wuhan, China: a Population-based Time-series Study. Environmental Science and Pollution Research. 2021.3, https://doi.org/10.1007/s11356-021-13180-6.
3. 柯思思, 张刚, 朱朝阳, 严亚琼. 基本公共卫生服务效率极其影响因素. 中国卫生资源.2021,24(1):75-78.（通讯作者）
4. 赵原原, 杨念念, 代娟, 金琦曼, 张晓霞, 严亚琼. 武汉市2009-2018年慢性阻塞性肺疾病死亡率变化趋势分析. 中国医院统计. 2021,28(2):101-104.（通讯作者）.
5. 严亚琼, 赵原原, 杨念念, 代娟, 程瑶, 龚洁. 武汉市大气污染对儿童呼吸系统门诊量影响的时间序列分析. 中国预防医学杂志. 2020,21(9):969-973.
6. Yan Guo, Xinghua Liu, Mengyao Deng, Pulin Liu, Fang Li, Nianhua Xie, Yanhui Pang, Xiaoxia Zhang, Wen Luo, Ying Peng, Yaqiong Yan, Gang Li, Mei Yang. Epidemiology of COVID-19 in older persons,Wuhan, China. Age and Ageing,2020,49:706-712.（通讯作者）
7. 李芳, 刘素, 李长风, 柯思思, 代娟, 严亚琼. 武汉市青少年超重肥胖状况及对被欺凌的影响. 中国学校卫生. 2020.41(9):1343-1345.（通讯作者）
8. Honglan Wei, Yaqiong Yan, Jie Gong, Junwu Dong. Prevalence of kidney damage in Chinese elderly: a large-scale population-based study[J]. BMC Nephrology,2019,20(341):1-9. https://doi.org/10.1186/s12882-019-1525-5.(共一)
9. 代娟, 龚洁, 杨念念, 赵原原, 严亚琼. 武汉市城区居民高血压与糖尿病流行特征及慢性病危险因素知晓情况. 中国慢性病预防与控制. 2019,27(9):663-667,671.（通讯作者）
10. Mei Yang, Yan Guo, Jie Gong, Mengyao Deng, Niannian Yang, Yaqiong Yan. Relationships between functional fitness and cognitive impairment in Chinese community-dwelling older adults: a cross-sectional study. Bmj Open, 2018, 8(5):e020695.（通讯作者）
11. 严亚琼,王亮,杨念念,孙惠玲,代娟,龚洁. 武汉市2013年城乡居民脑血管疾病死亡及减寿分析. 武汉大学学报:医学版, 2016,37(1):152-157.
12. Yaqiong Yan, Angela J. Jacques-Tiura, Xinguang Chen, Nianhua Xie, Jing Chen, Niannian Yang, Jie Gong, Karen Kolmodin MacDonell, Application of the Protection Motivation Theory in Predicting Cigarette Smoking Among Adolescents in China. Addictive Behaviors.2014, 39:181-188. 
13. Yan Yaqiong, Gong jie, Qian Zhengmin. Time trends in Incidence of Childhood Leukemia among urban Wuhan during 1988 - 2015. Invitation to international childhood cancer cohort consortium (I4C) annual meeting.In Tokyo, Japanese，November 13,2018.（Oral Presentation）
14. Yan Yaqiong, Qian Zhengmin. Wuhan Study：Cancer Incidence of Childhood in Urban Wuhan from 1993 to 2012, China. 14C International Meeting 16-17th November 2015,Oxford,UK.(Oral Presentation)
15. 儿童青少年视力健康管理（中小学生篇），2021年，教育科学出版社.（副主编）（5.9万字）
16. 《医院公共卫生工作规范》， 2018年，华中科技大学出版社.(副主编)（40万字）
17. 《高血压患者运动指南》，2017年，长江出版传媒.湖北科学技术出版社.（副主编）（5.0万字）
18. 《健康管理技术手册丛书——血脂异常分册》，2014年，长江出版传媒.湖北科学技术出版社.（主编）（5.4万字）
19. 《武汉医疗卫生机构健康管理工作指南》,人民卫生出版社. 2017.（编委）(34万字)